我亲自听佛这样说的：那个时候，佛陀在许多国度游化宣教。有一天他来到了广严城，看到一片浓浓的绿荫，在微风吹过时，树叶发出沙沙的响声，仿佛美妙的音乐，使人感受到了阵阵的清凉。于是，佛陀便止步安住于这乐音树下演说佛法。这时，佛陀的周围簇拥着八千位大比丘，还有三万六千位有德行的大菩萨们，以及各方诸多的国王、大臣、婆罗门和在家修行的推断此人的所作所为，计算其平时所累积的善恶多少，按其应得的罪福给予奖惩。」「这个时候，病人的亲属、师友如果能够为他皈依世尊药师琉璃光如来，延请僧众，一遍又一遍地为这病人转读这部『药师琉璃光如来本愿功德经』，同时点燃每层七盏，七层共计四十九盏的延寿长明灯，悬挂五种颜色的续命神幡，这样或许可能使病人的神识得以重返世间，使病人再次活转过来。」「凡是这种神识返回得以活转过来的病人，就好象从大梦中清醒过来一样，对于梦中所见所闻的一切，都会记忆犹新，清楚明了。其神识或许是经过了七天，或许是经过了二十一天，或许是经过了三十五天，或许是经过了四十九天才还苏回来。当神识返回这病人身上时，如同刚刚从梦中觉醒过来一样，都能清楚地回忆自己作恶或者行善所得到的善果业报。由于自己亲自见证应验了业果报应的缘故，这些人就是到死，也都不会再去造作任何恶业了。」「所以说呀，凡是具有清净信心的善男子善女人们，都应该信受奉持药师琉璃光如来的名号，按照自己的能力大小，至心地恭敬供养那世尊药师琉璃光如来。」这时候，阿难又向救脱菩萨问道：「救脱菩萨呀，作为善男子，他应当怎么做才能恭敬地供养那药师琉璃光如来呢？还有那续命的神幡和延年的长明灯又应该怎么做呢？」救脱菩萨回答说：「大德！如果有病人要想脱离疾病的痛苦折磨，那他的亲属、师友就应该为这病人用七天七夜的时间来受持、信奉八关斋戒。应该竭尽自己的所能，置备办理饮食和别的供养品；延请比丘僧人并加以恭敬供养；在昼夜的六时中(8点、12点、16点、20点、0点、4点)，虔诚地礼拜供养那世尊药师琉璃光如来；把这部『药师琉璃光如来本愿功德经』读诵四十九遍；点燃四十九盏长明灯；塑造七尊药师琉璃光如来的形象，每尊佛像前又各置七盏长明灯，每盏灯都应当大如车轮，在四十九日中，这些灯光明不绝；再造五种颜色的彩幢，使其有四十九桀手长(桀=23公分)；另外还应当把四十九种杂类众生放生。这样便可以度过危险的厄难，而不至于再遭受各种横恶鬼魅的劫持操纵了。」「还有，阿难呀！如果剎帝利、灌顶王等世间的国王遭受灾难时，即所谓的世间瘟疫难、他国侵逼难、国内叛逆难、星宿变怪难、日月薄蚀难、狂风暴雨难、久旱不雨难等等天灾人祸，则这些剎帝利、灌顶王等世间君主国王，这时便应该对一切有情众生发起慈悲之心，先是大赦天下被关押的囚犯，并且要依照前面所说的供养方法，虔诚地供养那世尊药师琉璃光如来。由于这样做所累积起来的善根功德，再加上那药师琉璃光如来的本愿之力，便可以令他们的国界安定稳固，风调雨顺，国泰民安，五榖丰收，一切有情众生都无灾无难、无病无痛地欢乐自在；在他们的国家之内，不会有任何暴恶夜叉等鬼神危害作祟，使有情众生烦恼忧虑；一切险恶的征兆都销声匿迹，不会再次出现；至于那剎帝利、灌顶王自己，则寿命增长，精力充沛，身心健康，无灾无病，自在快乐，举国上下也都各得增益。」「阿难啊！如果那些帝后、王妃、大子、王子、大臣、辅相、太监、宫女、百官及庶民百姓等，也为疾病所折磨，痛苦烦恼异常：或者是蒙受了别的灾难祸害的困厄，也应当造立起五色的神幡，点燃长明灯以求续命，再放生各式各样的有生命的物类，散发各式各样颜色的鲜花，焚烧各式各样名贵的供香，就能使得一切病痛最终得到解除痊愈，一切灾难得到摆脱消灭。」这时候，阿难救问救脱菩萨说：「菩萨啊！为什么众生已经到了尽头的生命还可以得到延续增益呢？」救脱菩萨回答道：「大德！你难道没有听如来曾经说过，有九种横死吗？所以他才劝说我们建造续命的长明灯和五色的神幡，并且修习各种善业，广求福德。由于修习福德，累积善业的缘故，所以直到寿命终结，人都不会再去经历痛苦，遭受灾难了。」阿难又问道：「九种横死是怎么样的呢？」救脱菩萨回答说：「首先，如果有这样的有情众生，得病虽然不是很严重危急，但却没有医生的诊断，得不到药物的治疗；或者，有些去看病的人，虽然有医生给予诊断疗治，但却给错了药，结果本不应当死的却死去了，这就是一种横死。另外又有一些人，相信世间的邪魔外道，妖孽巫师，听信他们胡说有祸有福的话，结果弄得自己心中惊惶失措，恐怖万分日夜忐忑不安。自己心中一旦丧失了平衡正见，便去请人看相算命，求签问卦，为追寻祸害的根源，甚至不惜杀害种种生命。他们还作法祭祀神灵，召请役使各种鬼魅魍魉，只为乞求福佑，大享平安，希冀能够延其寿命。殊不知，这种方法种就是不能如愿以偿的。愚昧无知，迷惑本性，信随邪魔，起倒乱见，使他终究遭受了横死之苦，沉沦于地狱之内，没有出离的日子，这便是第一种横死。」「第二种横死，因为违犯王法而遭到刑律的诛灭杀戮。第三种横死，肆意打猎，嬉闹游乐，沉迷于淫欲之中不能自拔，嗜酒如命毫无节制，以至于邪鬼恶神趁机夺其精气而遭横死。第四种横死，遭受火灾焚烧而死。第五种横死，溺水淹没而死。第六种横死，被各式各样的凶猛恶兽啖食而死。第七种横死，即从悬崖断壁上墬落而死。第八种横死，遭受毒药、厌祷、咒诅、起尸鬼等中伤毒害而死。第九种横死，因为饥饿焦渴的煎熬困厄，得不到点滴饮食而渴饿横死。上面这些是如来简单略举的九种横死，其他的各种横死还有许多许多，实在难以一一细说呀。」「还有呢，阿难！那阎罗法王主宰着世间一切众生的生死纪录簿。一切有情众生中，如果有那些子孙忤逆不孝的，还有破坏侮辱佛法僧三宝的，败坏君臣纲纪秩序的，违犯杀妄盗淫的根本性戒的，那么阎罗法王便会根据其所犯罪过的轻重加以审判拷问，量刑惩罚。因此我今天在这里劝告诸位有情众生，为了度过苦难厄运，免遭众多的灾祸，一定要点燃长明灯，建造无色神幡，供养那药师琉璃光如来，还要放生积善，广修福德，使一切灾难厄运消弭不再，以求平安欢乐。」这时，在听佛说法的会众之中，有十二位药叉大将也各在会座之中。他们分别是宫毗罗大将、伐折罗大将、迷企罗大将、安底罗大将、额?罗大将、珊底罗大将、因达罗大将、波夷罗大将、摩虎罗大将、真达罗大将、招杜罗大将、毗羯罗大将。这十二位药叉大将，各各领有七千名药叉作为部属。所有这些药叉同时举声向佛禀告：「世尊啊！我们今天承蒙佛陀您的神圣庄严的威力加被，得以听闻那世尊药师琉璃光如来的神圣名号，我们已经完全摆脱了对那可能轮回转生到三恶道去的结局的恐惧。我们一定要相互鼓励，同心协力，即使身体寿命都到了终结的那一天，也都要始终皈依佛法僧三宝；我们立誓要担负天下一切众生的苦难，为他们作种种义利之事，使其得到饶益安乐；无论在什么地方，无论在任何村邑、城镇、国家、及空闲的山间、林中，只要有此经流行传布，只要有人奉持那世尊药师琉璃光如来的名号并加以虔诚地供养的，我们以及我们所有的眷属，都会守护、保卫这个人，使他解脱一切苦难，如果他有什么愿望企求，都会使他得到一一满足；如果有人遭遇到疾病或者厄难而希望得到解脱的，也应该诵读『药师琉璃光如来本愿功德经』，并以五色的丝缕，把我们十二药叉大将的名字编织在丝缕结中，我们一定使他如愿以偿，使病痛痊愈，厄难解除，然后再解开丝缕结。」(佛教中的解厄法，可有二解：(1)以五色丝线结成十二药叉的名字(2)一边以丝线打结，一边称念十二药叉的名字)这时，世尊便对诸位药叉大将连声赞叹，并说：「善哉！善哉！药叉大将，你们能够思念着报答那世尊药师琉璃光如来的恩德，你们常常应该如此利益安乐一切有情众生啊！」这时候，阿难又对佛陀说道：「世尊！应当怎样称呼这个法门呢？

我等又应该如何奉持信守这法门呢？」佛陀告诉阿难说：「此法门的名称就叫做『药师琉璃光如来本愿功德』，又叫『十二神将饶益有情结愿神咒』，又叫『拔除一切业障法门』。你们就应该像我说的这样持守信奉这一法门。」佛陀说完这番话时，所有的大菩萨和佛身边所有的声闻大弟子，在场同闻佛法的国王、大臣、婆罗门、居士、天、龙、药叉、干达婆(香神或乐神)、阿修罗、迦楼罗(金翅鸟)、紧那罗、摩诃罗迦(大蟒神)、人及非人等等，一切大众，都因为听了佛陀宣说的法音而皆大欢喜，人人无不顶礼膜拜，信受奉行。